Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Svep1A2AVA0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms