Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tubb1A2AQ07 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tubb1A2AQ07 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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