Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Fam43bA2AM80 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam43bA2AM80 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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