Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Lcn6A2AJB9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lcn6A2AJB9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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