Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms