Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms