Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms