Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms