Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms