Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn8Q9Z260 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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