Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nme3Q9WV85 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms