Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trpc2Q9R244 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpc2Q9R244 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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