Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fhl3Q9R059 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fhl3Q9R059 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms