Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms