Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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