Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdcQ9QW08 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms