Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trappc2lQ9JME7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms