Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rabgef1Q9JM13 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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