Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfrsf19Q9JLL3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms