Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tlr5Q9JLF7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tlr5Q9JLF7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tlr5Q9JLF7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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