Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Habp4Q9JKS5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms