Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gpa33Q9JKA5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms