Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms