Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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