Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Syde1Q9DBZ9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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