Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms