Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Smg9Q9DB90 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smg9Q9DB90 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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