Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmem239Q9DA47 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.8 ms