Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnot8Q9D8X5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms