Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gtf3c6Q9D8P7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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