Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem54Q9D7S1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem54Q9D7S1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms