Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmigd1Q9D7L8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmigd1Q9D7L8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms