Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Nop56Q9D6Z1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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