Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm3404Q9D506 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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