Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PrameQ9D4Z5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrameQ9D4Z5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PrameQ9D4Z5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PrameQ9D4Z5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrameQ9D4Z5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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