Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy3Q9D394 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rufy3Q9D394 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms