Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trmt44Q9D2Q2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trmt44Q9D2Q2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trmt44Q9D2Q2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trmt44Q9D2Q2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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