Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmbr1lQ9D1E5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms