Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl28Q9D1B9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Mrpl28Q9D1B9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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