Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2e1Q9D0D5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms