Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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