Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hdhd3Q9CYW4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hdhd3Q9CYW4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms