Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ube2fQ9CY34 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms