Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Sgo1Q9CXH7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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