Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Xrcc3Q9CXE6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc3Q9CXE6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc3Q9CXE6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc3Q9CXE6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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