Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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