Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NubplQ9CWD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms