Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Fcf1Q9CTH6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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