Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim8Q9CQQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms