Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nicn1Q9CQM0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms